店舗の害虫駆除におすすめの業者11選｜料金・対応時間・保証を比較

店舗の害虫駆除は、お客さんのいない閉店後や開店前に作業を頼むことが多く、夜の時間帯は通常の料金に割増を付ける会社があります。

この記事では、営業時間外にも相談できる店舗の害虫駆除業者11社を、料金・見積もり・対応時間・最短対応・対応エリア・保証の6項目で比較。

さらに、閉店後の作業に付く割増の目安、10坪から30坪までの広さ別の料金、テナントの店が業者より先に管理会社へ連絡する理由まで紹介します。

※各社のスペックはいずれも2026年11月時点で公式サイトに掲載されている内容です。

店舗の害虫駆除業者おすすめ11選

1：害虫ファースト

害虫ファーストは、国家資格保有者が在籍し、年間10万件以上の依頼をこなす首都圏最大級の害虫駆除業者です。

24時間365日・最短30分で到着し、現地調査と見積もりは無料です。見積もり後のキャンセルも料金なしで対応します。

顧客満足度は98%以上で、永久保証と価格保証の両方を標準搭載しており、「一度駆除したら再発させない」という体制が整っています。

「緊急だが費用が心配」という場合でも、キャンセル料ゼロなのでまず見積もりだけ依頼して内容を確認してから決めることをおすすめします。

2：ダスキンほづみ

ダスキンほづみは、死骸・フン・卵までバキュームで除去し、薬剤の使用量を最小限に抑えられる害虫駆除サービスです。

ダスキン加盟店として厳格な品質基準のもと施工するため、初めて害虫駆除業者を利用する方でも安心して任せられます。

安全性の高い〈ベイト方式※〉〈バキューム吸引〉で施工するので、「薬剤をできるだけ使いたくない」「赤ちゃんやペットがいる」という方におすすめです。
※薬剤を散布するのではなく、ゴキブリの毒餌となる成分のベイト剤を塗りつけるタイプです。

今すぐ無料相談する

3：駆除ザウルス

駆除ザウルスは、創業21年・累計40,000件以上の相談実績を持つ害獣・害虫駆除の専門業者です。

現地調査と見積もりは完全無料で、見積もり後にキャンセルしても料金はかかりません。24時間365日受け付けており、最短当日で駆けつけます。

完全自社施工で仲介手数料がかからない分、料金を抑えやすい仕組みになっています。施工後は最長5年間の保証がつき、保証期間内に再発した場合は追加費用なしで対応します。

テレビ番組への出演実績も多数あり、Googleクチコミでは星4.8の高評価を得ています。「実績と評判の両方で選びたい」という場合は、まず無料の現地調査を依頼して見積もり内容を確認することをおすすめします。

4：害虫駆除のアールクリーニング

害虫駆除のアールクリーニングは、累計作業実績50万件を突破した首都圏密着の害虫駆除サービスです。

最短10分で到着・即日対応が可能で、出張見積もりは無料です。突発的な害虫トラブルにも迅速に対応します。

50万件以上の施工実績を持ち、豊富な現場経験に基づいたプロ品質の駆除を受けられます。

「今日中に対応してほしい」「一都三県のエリアで実績ある業者を探している」という場合は、まず無料の出張見積もりを依頼することをおすすめします。

今すぐ無料相談する

5：害虫駆除110番

害虫駆除110番は、子供やペットにも安全な薬剤を使用し、1年間の保証付きで害虫を駆除する全国対応サービスです。

現地調査・見積もり・キャンセルがすべて無料で、最短即日・30分での診断が可能なため、急ぎの場合にも対応できます。

施工後は1年間の保証がつき、追加料金は一切発生しません。見積もり金額がそのまま最終的な支払い額になります。

「小さい子供やペットがいるので薬剤が心配」「見積もり後に断っても費用がかかるか不安」という場合は、気軽に無料見積もりから相談することをおすすめします。

6：街角害虫駆除相談所

街角害虫駆除相談所は、最短15分で到着できる即応体制と5年保証を両立した害虫駆除の相談窓口です。

現地調査と見積もりは無料で、施工後は1年後に無料点検も実施するため、駆除後の再発にも長期的に対応します。

年間1,500件以上の実績を持ち、5年間の保証制度が標準でついているため、費用対効果を重視する方に向いています。

「今すぐ対応してほしいが、費用の見通しも立てたい」という場合は、無料見積もりを依頼してから判断することをおすすめします。

今すぐ無料相談する

7：害虫駆除イーバスター

害虫駆除イーバスターは、全国の加盟店が24時間365日受け付ける害虫駆除業者です。

基本的には、出張費と見積もりが0円で、見積もり後の追加請求もないため、金額の不安なく呼べるのが強み。

運営事務局による厳しい審査基準をクリアした加盟店しか加盟しておらず、確かな施工実績・明朗会計の徹底・丁寧な説明ができる対応などが徹底されています。

対応スピードやコスパを重視する人には特におすすめです。

今すぐ無料相談する

8：ムシプロテック

ムシプロテックは、年間実績10,000件以上の加盟店ネットワーク型の害虫駆除サービスです。

ゴキブリ・ダニ・ノミ・シロアリ・毛虫・ハチ・ムカデに対応し、最寄りの加盟店のスタッフが訪問します。相談・出張費・見積もりの3つが0円で、追加料金もありません。

最短5分で駆けつける対応の速さと熟練した加盟スタッフの作業で、お客様満足度99%に挑戦中と掲げています。

今すぐ無料相談する

9：害獣害虫駆除王

害獣害虫駆除王は、関西・東海・関東の12都府県で問い合わせから施工までを自社の職人だけで完結させる駆除業者です。

現地調査と見積書の作成は無料で、業界歴は約10年以上です。再発させないことを掲げて最長永久保証を用意しています。

また、見積もり後の追加費用がない明朗会計なので安心です。

緊急の処置から再発を防ぐ工事まで完全自社施工なので、下請けに回されるのが不安な方にもおすすめです。

今すぐ無料相談する

10：大洋防疫研究所

大洋防疫研究所は、事業者向けの駆除料金を店の面積ごとに公開している会社です。

ゴキブリ駆除は33平方メートル（10坪）まで初回27,500円から、66平方メートルまで33,000円から、99平方メートルまで38,500円からで、10坪増えるごとに5,500円からが加算されます。（参考：大洋防疫研究所「料金案内」）

17時以降の夜間作業は3,300円から、22時以降の深夜作業は5,500円からの加算と書かれているため、閉店後に頼んだときの上乗せ額を電話の前に計算できます。

大洋防疫研究所は電話の受付が平日の日中に限られる一方、施工は年末年始を除いて24時間受け付けているので、夜に閉める店でも作業の時間を合わせやすい会社です。

大洋防疫研究所の公式サイトには保証の年数が書かれていないので、再発したときの対応は見積もりの段階で聞いておく必要があります。

今すぐ無料相談する

11：イカリ消毒

イカリ消毒は、1959年設立・従業員1,540人（2026年1月現在）の防虫防鼠の専門会社です。（参考：イカリ消毒「会社概要」）

イカリ消毒は対応する業種にチェーン飲食店・食品スーパーのデリカ部門・コンビニエンスストア・ホテルを挙げていて、食品を扱う店舗の防虫防鼠が仕事の範囲に入っています。（参考：イカリ消毒 公式サイト）

イカリ消毒は単発の駆除より、調査から報告までを年間で回す契約が中心なので、複数の店を同じ基準で管理したいチェーン店に合います。

イカリ消毒は料金と受付時間を公開していないので、金額は問い合わせの段階で確かめてください。

今すぐ無料相談する

店舗の害虫駆除は閉店後と開店前に頼める

店舗の害虫駆除は、お客さんが売場にいない閉店後か開店前に作業を頼めます。

薬剤を散布する作業は処理のあいだ売場に人が入れないので、営業しながら進めることができません。

受付が24時間の業者でも、作業を始められる時刻は地域の担当店で変わるので、夜の何時に来られるかを電話で聞いてください。

閉店後の作業は1回3,300円から割増が付く

閉店後に店舗の害虫駆除を頼むと、通常の料金に夜間や深夜の割増が加わる料金表があります。

定期サービスの作業を平日の日中に限る会社もあり、事業所向けの料金表に「通常定期サービスの場合、平日日中での作業となります」と注記している例があります。（参考：ダスキンほづみ「ゴキブリ駆除」）

夜にしか売場を空けられない店には、平日の日中だけの定期プランは向いていません。

定休日がある店なら、休みの日の昼に作業してもらうと割増がかからずに済みます。

営業中はベイト剤、散布は閉店後に

営業中の店舗で頼める害虫駆除はベイト剤の設置で、薬剤の散布やくん煙は閉店後の作業になります。

殺虫剤の霧は天井の煙感知器を鳴らすことがあり、日本火災報知機工業会は火災ではないのに警報が出る原因の1つに「殺虫剤散布」を挙げています。（参考：日本火災報知機工業会「自動火災報知設備の非火災報等への対応について」）

自動火災報知設備のあるビルに入っている店は、散布やくん煙をする日をビルの管理会社へ前もって伝えておきましょう。

ゴキブリ駆除の作業にかかる時間と、立ち会いが要る場面は、処理する場所ごとに違います。

店舗の害虫駆除費用は広さと時間帯で変わる

店舗の害虫駆除費用は、売場とバックヤードを合わせた広さで初回の料金が決まり、夜間に頼むとその上に割増が加わります。

一般の集合住宅は9,000〜12,960円なので、店舗は2倍近い金額になります。（参考：ミツモア「ゴキブリ駆除の料金相場」）

10坪・20坪・30坪の初回料金と継続料金

事業者向けのゴキブリ駆除は、10坪までの店なら初回27,500円から、半年ごとの継続が22,000円からという料金表があります。

売場だけに出ていたゴキブリを放置すると、バックヤードや倉庫まで処理の範囲が広がり、10坪増えるごとの加算がそのまま上乗せされる計算です。

4週間ごとに通う定期サービスの例では、50㎡（約15坪）までが初回19,800円、2回目以降が6,600円です。（参考：ダスキンほづみ「ゴキブリ駆除」）

定期保守とスポットは虫が戻るかで選ぶ

店舗の害虫駆除を1回のスポットで終えるか定期保守にするかは、初回の駆除から1か月のあいだに虫がまた出るかが判断基準になります。

従業員を雇う店舗は、労働安全衛生規則第619条で、ねずみや昆虫の発生場所と侵入経路を6か月以内ごとに1回調べるよう求められています。（参考：e-Gov法令検索「労働安全衛生規則」）

市販の粘着トラップに3日続けて虫がかかる店は、棚の裏や壁の中に巣が残っている可能性が高いので、スポットを繰り返さずに定期保守の見積もりも出してもらいましょう。

定期契約にするか迷っている場合は、契約が要る店と要らない店の違いを先に確かめておきましょう。

店舗の害虫駆除業者を選ぶ4つの基準

店舗の害虫駆除業者は、店の広さで料金を出せるか、商品を汚さずに作業できるか、ネズミやコウモリも頼めるか、調査が無料かの4点で比べられます。

基準1：店舗用の料金を見積もりで出せるか

店舗や事業者向けの料金表があるかは、見積もりを頼む前に公式サイトで確かめられます。

公開されている料金の幅でも、一般家庭の6,600〜25,000円前後に対して、飲食店や店舗は6,600〜50,000円前後と上限が2倍に広がる例があります。（参考：害虫駆除イーバスター「料金表」）

家庭向けの料金のつもりで店舗を頼むと金額が上がるのは、現地で売場とバックヤードまで広さを測るからです。

基準2：商品と什器を汚さない施工か

商品を並べたままの店舗では、薬剤をどこに使って何を覆うかを作業の前に説明してくれる業者が向いています。

噴射式の薬剤は処理中に室内へ入れないうえ、飲食店では食器や調理用具についた薬剤をすべて洗い流す手間も出ます。（参考：ダスキンほづみ「ゴキブリ駆除」）

作業の前に、覆うか別の場所へ移すかを決めておきたいものは次のとおりです。

覆う作業が料金に入っているかは、見積書の作業内容の欄に書かれます。

基準3：ネズミやコウモリも同じ会社に頼めるか

店舗で虫と一緒にネズミの糞やかじり跡が見つかったときは、害虫と害獣の両方を扱う会社なら1回の現地調査でまとめて見てもらえます。

害虫だけを扱う会社に頼んだ場合、ネズミは別の会社を探し直すことになり、現地調査の立ち会いも2回に増えます。

基準4：現地調査と見積もりが無料か

店舗の害虫駆除は、現地調査と見積もりを無料と書いている会社なら、金額を聞いてから断れます。

調査が有料の会社では、店の広さと被害の範囲を見てもらっただけで出張費が残ります。

無料の範囲は会社ごとに違い、出張費・見積もり・キャンセル料が別々の欄に書かれていることもあるので、3つとも0円かを電話で確かめてください。

キャンセル料まで0円の害虫駆除業者は、以下の記事にまとめています。

テナント店舗の害虫駆除は誰が手配するか

商業ビルやショッピングセンターに入っている店舗は、自分で業者を呼ぶ前にビルの管理会社へ連絡しましょう。

商業ビルの店は管理会社に先に連絡する

テナントの店舗で虫やネズミを見たときに管理会社へ伝えるのは、見た場所・日時・写真の3つです。

東京都のねずみ防除指針のQ&Aでは、ビル本体の防そ工事は所有者が行い、テナントはごみや食品の扱いと清掃のルールを守るという役割分担が示されています。

侵入口の封鎖がビル側の工事にあたる場合、店が自分の判断で封鎖まで頼むと、その費用を店で払うのか所有者に請求できるのかが曖昧なまま残ります。

3,000㎡以上の建物はビル側に防除の義務

店舗が入る建物の延べ面積が3,000㎡以上なら、建築物衛生法の特定建築物にあたり、ねずみや害虫の点検と防除はビル側が行う管理に入ります。

特定建築物の調査は建築物衛生法施行規則で6か月以内ごとに1回と決められていて、東京都はさらに毎月1回以上の点検を指導基準にしています。（参考：東京都健康安全研究センター「Q&A 5 清掃・ねずみ等防除について」）

同じセンターのQ&Aは、専有部と共用部を区別せずに生息状況をつかむようビル側に求めているので、店の中で見た虫も点検の対象です。

ネズミの侵入口を塞ぐ工事は、穴の数と使う材料で1か所ごとに費用が変わります。

店舗の壁のすき間に住むコウモリとネズミ

店先やシャッターの下に黒い粒の糞が続けて落ちているときは、壁のすき間に住むコウモリかネズミの可能性があります。

たとえば京都市の資料によると、市街地で見るコウモリのほとんどはアブラコウモリで、巣は壁の間や天井裏などのすき間にあり、数十匹が同じ巣にいることもあります。（参考：京都市「衛生動物だより No.027 イエコウモリ」）

同じ資料が挙げている、コウモリの糞とネズミの糞の違いは次のとおりです。

浜松市の案内では、コウモリは捕獲に許可が要る動物で、侵入口の封鎖を避ける時期はまだ飛べない幼獣がいる6〜8月と冬眠の前後です。（参考：浜松市「コウモリによる被害について」）

市は原則として捕獲や駆除をしていないので、店の外壁の高い位置やシャッターの上で自分では塞げない場合は、追い出しと封鎖を業者に頼みましょう。

コウモリの追い出しと封鎖にかかる費用の幅は、以下の記事で紹介しています。

【FAQ】店舗の害虫駆除でよくある質問

Q：店舗の害虫駆除は営業中でもできる？

店舗の害虫駆除は、ベイト剤を置く作業なら営業中でもできます。薬剤の散布やくん煙は処理中に人が入れないので、閉店後か定休日の作業になります。

Q：食品を売る店も年2回の駆除が必要？

食品を扱う店舗の害虫駆除は、食品衛生法施行規則の別表第17が、ねずみと昆虫の駆除作業を1年に2回以上行い、その記録を1年間保存するよう定めています。（参考：宮城県「公衆衛生上必要な措置に関する基準の解説について」）

同じ別表には、発生場所や侵入経路を定期に調べて必要な措置を取るなら、店の状況に応じた方法と頻度で行えるという但し書きもあります。

食品を扱う店の定期契約で契約書を見るときは、年2回の数え方と解約の予告期限が確認点です。

Q：店舗の害虫駆除は保健所に頼める？

店舗の害虫駆除の依頼先は保健所ではなく、民間の駆除業者です。

たとえば東京都多摩小平保健所の案内には「保健所では、防除や駆除作業は実施しておりません」とあります。（参考：東京都多摩小平保健所「衛生害虫に関すること」）

保健所からは、自分で対応できない場合に害虫駆除業者団体の連絡先を紹介してもらえます。

Q：見積もりだけ頼んで断っても無料？

現地調査と見積もりを無料と書いている業者なら、見積もりだけ頼んで断っても調査の費用はかかりません。

出張費とキャンセル料は見積もりとは別の欄に書かれていることがあり、3つとも0円かは申し込みの前に電話で確かめられます。

ゴキブリ駆除の費用は、間取りと被害の広さで相場が分かれます。

まとめ｜店舗の害虫駆除業者の決め方

店舗の害虫駆除業者を選ぶときの判断基準になるのは、店の広さで料金を出せるか、閉店後に作業できるか、ネズミやコウモリもまとめて見てもらえるかの3つです。

今日の閉店後に、レジの下・バックヤードの棚の裏・トイレの床に糞や死骸がないかを確かめ、見つけた場所をスマートフォンで撮っておいてください。

現地調査と見積もりを無料としている業者もあるので、閉店後に来てもらえるかを聞いたうえで、まずは無料の現地調査を依頼してみてください。